中国输血杂志

2017, v.30(10) 1114-1117

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KIR 3DL3基因cDNA分子克隆测序法鉴定1个常见型新等位基因
Identification of a common KIR3DL3 novel allele by molecular cDNA cloning and haplotype sequencing

邓志辉;夏华动;张国彬;陈瑞;蔡思齐;

摘要(Abstract):

目的建立KIR3DL3基因c DNA分子克隆测序方法,鉴定在南方汉族人群中新发现的1个KIR3DL3等位基因。方法对1例KIR3DL3基因测序分型结果异常的标本,采集EDTA抗凝新鲜外周血样,提取mRNA,反转录成c DNA后,采用1对KIR3DL3基因特异性PCR引物对全部编码区序列做PCR扩增,扩增产物经切胶回收纯化后,做分子克隆和单体型测序。结果经分子克隆和测序,检出1个正常的KIR3DL3*01002等位基因和1个新变异的KIR3DL3等位基因,该新等位基因的序列与KIR3DL3*048最相近,但存在编码区(CDS)nt 1074 A>G同义突变,位于第8外显子的第337密码子由CAA变成CAG,其序列提交国际Gen Bank(序列号:KU529269)和IPD-KIR Database(IWS40002178),已被世界卫生组织(WHO)HLA因子命名委员会KIR分委会正式命名为KIR3DL3*04802,该新等位基因在306名南方汉族无关个体中共检出12次,检出频率为3.92%。结论成功建立KIR3DL3基因c DNA分子克隆测序方法,在等位基因水平的KIR研究中具有良好的应用前景。

关键词(KeyWords): KIR3DL3基因;;cDNA;;分子克隆和单倍体测序;;新等位基因

Abstract:

Keywords:

基金项目(Foundation): 国家自然科学基金(81373158)

作者(Author): 邓志辉;夏华动;张国彬;陈瑞;蔡思齐;

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